ปราสาทฮิโกเนะเป็น 1 ใน 12 ปราสาทยุคเอโดะที่ยังคงอยู่รอดมาจนถึงปัจจุบัน ตัวปราสาทมีทั้งหมด 3 ชั้น ตามหลักฐานกล่าวว่าปราสาทแห่งนี้น่าจะสร้างขึ้นตั้งแต่ปี 1575 ในฐานะส่วนหนึ่งของปราสาทโอซึ (Otsu Castle) กระทั่งตัวปราสาทสร้างเสร็จสมบูรณ์ในปี 1622
ลักษณะอาคารปราสาทยังคงเป็นแบบดั้งเดิมเนื่องด้วยไม่ได้รับผลกระทบจากสงครามจึงทำให้ปราสาทฮิโกเน่เป็น 1 ใน 4 ปราสาทญี่ปุ่นที่ได้รับการขึ้นทะเบียนเป็นมรดกแห่งชาติ แม้ว่าปราสาทจะไม่ใหญ่โตมากแต่พื้นที่โดยรอบก็กว้างขวางใช้ได้เลยทีเดียว พื้นที่ในอาณาบริเวณปราสาทถูกจัดแบ่งอย่างลงตัว
ย้อนกลับไปในสมัยปฏิรูปเมจิอันเป็นการสิ้นสุดระบอบโชกุน สมเด็จพระจักรพรรดิมีคำสั่งให้รื้อถอนปราสาทหลายแห่งทั่วประเทศซึ่งต้องถือว่าโชคดีมากที่สมเด็จพระจักรพรรดิปล่อยให้ปราสาทฮิโกเน่รอดพ้นการทำลายมาได้และกลายเป็นมรดกสำคัญของชาติในปัจจุบัน
